本公司提供的耐熱DNA聚合酶徹底去除宿主基因組DNA和表達載體DNA,避免由于酶本身的DNA殘留而導緻的假陽性;優化Buffer體系,提高(gāo)了PCR的靈敏度和特異性。
下(xià)表為(wèi)三種耐熱DNA聚合酶的基本特性:
基本特性 |
5'→3'外切酶活性 |
3'→5'外切酶活性 |
末端加A |
延伸速度 |
有效擴增長(cháng)度 |
Taq DNA polymerase |
有 |
無 |
有 |
1-2 kb/min |
簡單模5 kb,複雜(zá)模闆3 kb |
pfu DNA polymerase |
無 |
有 |
無 |
0.5 kb/min |
簡單模3 kb,複雜(zá)模闆1 kb |
Taq plus DNA polymerase |
有 |
有 |
有 |
1 kb/min |
簡單模15 kb,複雜(zá)模闆10 kb |
5'→3'外切酶活性:延伸至配對雙鏈區時延伸受阻,此時新合成的互補鏈上(shàng)形成“切刻”,5'→3'外切酶活性被激活:水(shuǐ)解“切刻”5' 堿基,同時在“切刻”3' 合成新的堿基,此過程稱為(wèi)“切刻平移”。Taqman探針法Realtime PCR正是利用Taq 5'→3'外切酶活性水(shuǐ)解探針,釋放(fàng)熒光(guāng)信号。
3'→5'外切酶活性:PCR延伸過程嵌入錯(cuò)配堿基時延伸受阻,3'→5'外切酶活性被激活:切除錯(cuò)配堿基,繼續延伸。但是3'→5'外切酶活性無法切除dUTP,并且pfu無法脫落,因此dUTP是pfu的不可逆抑制劑。dCTP會(huì)緩慢(màn)脫氨産生(shēng)dUTP,反複凍融會(huì)加劇此過程,因此應盡可能(néng)小(xiǎo)體積分裝dNTP以減少反複凍融次數。
突變與保真性:随機(jī)突變:Taq無3'→5'外切酶活性,延伸過程嵌入錯(cuò)配堿基時大多(duō)數情況是延伸終止,但有一(yī)定的概率延伸可以繼續,産生(shēng)随機(jī)突變。pfu和Taq Plus具有3'→5'外切酶活性,能(néng)避免因嵌入錯(cuò)配堿基造成的随機(jī)突變。
C:G→T:A突變:DNA鏈中的胞嘧啶(C)會(huì)緩慢(màn)脫氨為(wèi)尿嘧啶(U),從(cóng)而産生(shēng)C:G→T:A突變,高(gāo)溫會(huì)加劇此過程,使用pfu或者Taq Plus無法避免這種突變。因此,應盡可能(néng)使用較少的循環數,以減少DNA鏈中C→U轉化比例,從(cóng)而減少C:G→T:A突變。
PCR産物(wù)末端加A:延伸結束後,Taq在合成産物(wù)的3' 額外添加A形成粘末端,後者可以與T載體3' T配對。